Кафедра была образована в январе 1964 года после разделения кафедры марксизма-ленинизма, в состав которой к этому моменту входили еще кафедра «История» и «Политэкономия». За время работы кафедры ее коллектив то увеличивался (к сентябрю 1978 года вместе с лабораторией конкретных социальных исследований в подразделении работали 43 человека), то уменьшался (в настоящий момент на кафедре работают 23 преподавателя (на 20 ставках), зав. кабинетом и 3 инженера)

Преподаватели кафедры защитили 9 докторских и более 30 кандидатских диссертаций по философии, стали заведующими кафедрами философии многих петербургских вузов. За все время существования кафедры было публиковано более 50 монографий и свыше 500 научных и учебно-методических работ. Наиболее продолжительно (со дня основания кафедры до 1991 года) руководил кафедрой доктор философских наук, профессор, член-корреспондент Академии транспорта России, почетный железнодорожник Виктор Васильевич Ильин, который проработал в ПГУПС 46 лет (1961-2006).

С 1991 по 2016 год кафедру возглавлял профессор Владимир Петрович Огородников, доктор философских наук, действительный член Академии гуманитарных наук РФ, действительный член Петровской академии наук и искусств, член-корреспондент Российской академии естествознания, член-корреспондент Международной академии наук высшей школы.